在亚太地区，HBV感染者往往易合并HIV感染。HIV感染引起的免疫抑制使细胞对HBV的免疫应答减弱，肝脏炎症得以改善，但发展至肝纤维化的危险并未减少，HBV感染对HIV的发展变化也无影响。抗逆转录病毒药物能直接造成肝损，以致慢性肝炎患者的ALT增高。高效逆转录病毒疗法(HAART) 能改善免疫性，当细胞毒性淋巴细胞的免疫应答改善，通常在HAART治疗后3月肝炎就会爆发。肝炎的爆发往往紧跟着ALT转为正常及HBVDNA清除而发生。如果HAART中包括拉米夫定，肝炎的爆发可能较晚。慢性HBV感染的治疗包括干扰素 (IFN)，核苷酸类似物。拉米夫定，阿的夫韦，坦那夫韦 (DF)均是核苷酸类似物，具有对抗HBVDNA聚合酶及HIV逆转录酶的活性。后二者加入了抗拉米夫定抵抗的HBVDNA的活性。在慢性乙肝合并HIV感染的患者的最初治疗时应避免使用拉米夫定，因为该药的HBVDNA抵抗发生率极高。干扰素在最初就应使用，因为在HIV感染后期，免疫抑制达到最高峰，此药的效果就不理想。